Inclòs el formaldehid i el glutaraldehid. El principi d'aquesta desinfecció és que un agent alquilant actiu actua sobre els grups amino, carboxil, hidroxil i sulfhidril en la proteïna microbiana, destruint així les molècules de proteïna i causant la mort dels microorganismes. Tant el formaldehid com el glutaraldehid poden matar diversos microorganismes. Com que tenen efectes estimulants i curants sobre la pell humana i les membranes mucoses i poden sensibilitzar les persones, no es poden utilitzar per a la desinfecció d’aire, estris, etc., i generalment només s’utilitzen als hospitals. Desinfectar o esterilitzar els dispositius mèdics, i desinfectar o esterilitzar els articles s’han d’esbandir amb aigua estèril abans de l’ús.
